Project X Zone menampilan lebih dari 50 karakter dari 29 game yang di miliki oleh 3 perusahaan video game paling terkenal. Pada Project X Zone, pemain akan menggunakan sebuah tim yang terdiri dari 2 karakter yang akan di sebut sebagai Pair Unit untuk menjelajahi dunia dari game Project X Zone. Sebuah karakter tambahan yang akan di sebut sebagai Solo Unit yang dapat di gabungkan dengan Pair Unit supaya dapat membantu dalam pertempuran dengan menggunakan Solo Attacks maupun menambah serangan yang dapat di pilih pemain.