Bayangan akan perang sipil mulai mendekat ke Lanzheim Kingdom dan Juto, seorang pemuda yang telah kehilangan mengenai masa lalunya mungkin akan menjadi kunci untuk mengakhiri peperangan ini.
Magnacarta 2 akan menyajikan sebuah game role-playing yang unik yang menggabungkan antara real-time action, timing-based attacks, kombinasi over-drive dan juga penggunaan secara strategis dari skill, kemampuan sihir dan juga serangan-serangan kritikal dalam perjalanannya mencari takdir dirinya yang sebenarnya di tengah-tengah tragedi dan peperangan.