Terlempar kedalam dunia parallel dengan berbagai keanehan yang terjadi. Zelda kembali menjalani petualangannya dalam menghadapi kejahatan. Sebuah kekuatan kegelapan bernama majora’s mask telah merasuki kehidupan para warga kota termina, dan bukan hanya itu saja. Kalian akan menghadapi sebuah permasalah yang lebih rumit lagi, sebuah akhir dunia dimana karena kekuatan dari majora’s mask tersebut menarik turun bulan hingga mendekat ke bumi. Kalian hanya punya waktu 72 jam sebelum semuanya berakhir.