Planet Fusion telah menjelajahi galaksi selama ribuan tahun dan memangsa apapun yang bisa dia temukan. Kali ini dia menemukan Cartoon Network Universe! Dia segera mulai menciptakan berbagai karakter jahat dan menggerogoti dunia. Sebagai jagoan yang dapat mengendalikan karakter-karakter yang ada dalam Cartoon Network Universe, tugasmu adalah mendirikan barisan pertahanan terakhir dan menghancurkan rencana jahat dari Planet Fusion.