Game ini adalah hasil adaptasi dari film berjudul sama. Ketika Jared Simon dan Mallory Grace memasuki area Spiderwick, mereka menemukan sebuah panduan tentang dunia peri. Tidak lama, mereka kemudian menemukan sebuah dunia yang tersembunyi dan dihuni oleh brownies, goblin dan sprite. Ternyata, Jared dan saudara-saudaranya berada dalam bahaya besar karena seorang ogre bernama Mulgarath ingin mencuri buku panduan tersebut dari mereka dengan cara apapun.