Ketika teroris mengancam kota New York dengan penyakit mematikan, Seorang agen spesial dari UNATCO bernama J.C.Denton melakukan suatu misi untuk menghentikan mereka. Pikiran dan tubuh Denton telah dilengkapi dengan teknologi nano yang memberikannya kekuatan untuk menghadapi teroris-teroris tersebut. Selagi bertarung melawan teroris-teroris tersebut, Denton menemukan sesuatu yang tak terduga, bahwa UNATCO sendiri mungkin melakukan persekongkolan melawannya. Tanpa mengetahui siapa teman ataupun musuh, Denton terus maju dan tidak akan pernah berhenti hingga mendapatkan kebenaran atas semua yang terjadi.