Dalam game ini kita diharuskan melindungi saudara-saudara kita di hutan dari kejaran para monster. Bangunlah berbagai menara yang nantinya akan langsung menembak semua musuh kita yang mendekat. Pastikan penempatan menara dan strategi yang digunakan adalah yang terbaik agar teman-teman tidak dijadikan makanan kecil pengganjal perut monster-monster yang menjadi musuh kita. PixelJunk Monsters Deluxe menampilkan sebuah pulau dengan 11 stage, monster-monster dan bos yang unik.