Game ini juga dikenal dengan nama R-Type Tactics. Manusia nyaris putus asa melawan makhluk asing misterius Bydo, maka dari itu mereka mengirim para petarungnya ke Bydo. Namun dari semua yang dikirim tidak ada yang terdengar lagi kabarnya. Harapan ras manusia satu-satunya adalah seorang komandan militer. Bersama dengan armada kecilnya, dia dikirim ke pusat Kerajaan Bydo. Dengan perbekalan bahan bahar yang sedikit, sang komandan harus memimpin pasukannya tanpa harapan untuk bisa pulang dengan selamat.