Ar Tonelico Qogais merupakan game terakhir dari franchise Ar Tonelico. Game ini akan menggunakan Sol Cluster, sebuah kerajaan yang dipimpin oleh sebuah organisasi yang disebut dengan Clustania dan tujuan utama mereka adalah untuk memperbudak umat manusia dan menguasai dunia. Tapi, dua Reyvateils (humanoids) utama yang mereka butuhkan dalam usaha mereka itu telah bertemu dengan Aoto dan mereka pun bertarung melawan semua tindak ketidakadilan tersebut.
Bagian ketiga dari franchise Ar Tonelico ini menandakan pendekatan baru terhadap genre RPG dengan menggabungkan permainan simulasi dengan role-playing. Gamer tidak hanya bisa mengkustomisasi senjata dan barang saja, tapi sekarang juga bisa mendesain sendiri kepribadian, kemampuan serta penampilan dari karakter utama melalui bantuan interaksi virtual. Selain itu, beberapa kejadian yang sudah pernah terjadi sebelumnya akan terhubungkan dengan game yang dimainkan setelah game tersebut berhasil diselesaikan. Grafis dan sistem pertarungan disini pun merupakan sesuatu yang telah diciptakan dari awal sehingga nantinya akan menghasilkan sebuah pengalaman bermain yang sangat unik.