Harry Mason dan putrinya, Cheryl sedang menuju ke sebuah kota kecil yang ada di  bagian barat tengah. Tiba-tiba, Harry melihat sesosok bayangan di jalanan dan  akhirnya mencoba membelokkan arah kendaraan agar bisa menghindarinya. Hasilnya  adalah sebuah kecelakaan yang cukup serius. Setelah ia menyadarkan diri, Harry  menyadari bahwa ia telah menabrak sesuatu dan Cheryl telah menghilang. Kamu  harus mengarahkan Harry melalui sebuah kota  aneh yang bernama Silent Hill dalam usahanya mencari putrinya. Apakah Harry  bisa menyelamatkan putrinya dan menyelamatkan diri dari kota Silent Hill itu?
Didesain secara khusus untuk menggunakan kemampuan yang ada  pada kontroler Wii, Silent Hill:  Shattered Memories akan menggunakan Wiimote sebagai obor dan juga ponsel  dalam usahanya untuk mencari petunjuk. Obor yang ada disini sangatlah penting  untuk menjelajahi bangunan yang gelap dan terbengkalai yang ada di Silent Hill.  Sedangkan ponselnya akan berperan sebagai interface user yang memungkinkan  gamer untuk mengakses map dengan menggunakan fitur GPS dan mengambil foto-foto  dari beberapa elemen yang menarik. Wiimote itu juga bisa digunakan untuk mengambil,  memeriksa serta memanipulasi beberapa benda yang ada untuk menyelesaikan  teka-teki yang kamu temukan selama perjalanan kamu. Perlu diketahui bahwa  teknologi seperti itu masih belum ada saat Silent Hill pertama dirilis pada  tahun 1999 dan penyertaan fitur tersebut menunjukkan niat dari Konami untuk  meningkatkan permainan yang ada dengan teknologi baru.