Harry Mason dan putrinya, Cheryl sedang menuju ke sebuah kota kecil yang ada di bagian barat tengah. Tiba-tiba, Harry melihat sesosok bayangan di jalanan dan akhirnya mencoba membelokkan arah kendaraan agar bisa menghindarinya. Hasilnya adalah sebuah kecelakaan yang cukup serius. Setelah ia menyadarkan diri, Harry menyadari bahwa ia telah menabrak sesuatu dan Cheryl telah menghilang. Kamu harus mengarahkan Harry melalui sebuah kota aneh yang bernama Silent Hill dalam usahanya mencari putrinya. Apakah Harry bisa menyelamatkan putrinya dan menyelamatkan diri dari kota Silent Hill itu?
Didesain secara khusus untuk menggunakan kemampuan yang ada pada kontroler Wii, Silent Hill: Shattered Memories akan menggunakan Wiimote sebagai obor dan juga ponsel dalam usahanya untuk mencari petunjuk. Obor yang ada disini sangatlah penting untuk menjelajahi bangunan yang gelap dan terbengkalai yang ada di Silent Hill. Sedangkan ponselnya akan berperan sebagai interface user yang memungkinkan gamer untuk mengakses map dengan menggunakan fitur GPS dan mengambil foto-foto dari beberapa elemen yang menarik. Wiimote itu juga bisa digunakan untuk mengambil, memeriksa serta memanipulasi beberapa benda yang ada untuk menyelesaikan teka-teki yang kamu temukan selama perjalanan kamu. Perlu diketahui bahwa teknologi seperti itu masih belum ada saat Silent Hill pertama dirilis pada tahun 1999 dan penyertaan fitur tersebut menunjukkan niat dari Konami untuk meningkatkan permainan yang ada dengan teknologi baru.