Bersetting tahun 2069, Syndicate membawa pemain ke dalah suatu kegelapan, dunia Machiavellian yang berjalan tanpa pengawasan pemerintah dengan banyaknya sindikat yang banyak bersaing untuk mendominsasi total pasar lokal mereka. Dengan tidak ada satupun pertanyaan tentang niat atau aksi mereka, tiga perusahaan besar Eurocorp, Cayman Global dan Aspari adalah perusahaan yang berada di posisi depan dalam perang brutal untuk menguasai pasar penting di Amerika.