Shattered Union bersetting di suatu cerita fiksi, dimana di Amerika Serikat terdapat banyak puing-puing reruntuhan akibat terjadinya perang saudara. Pemain akan bermain sebagai salah satu pihak dari banyak pihak yang ingin menguasai dan mempersatukan kembali Amerika Serikat dengan idealismenya. Tujuan dari permainan ini adalah menguasai semua wilayah di Amerika Serikat dengan kekerasan.