The Legend of Zelda: Spirit Tracks akan membawa sang pahlawan kita Link untuk menjalani sebuah petualangan baru. Beragam jenis permainan baru ditawarkan dalam game ini. dalam game ini Link bertualang menggunakan sebuah kereta api, yang memungkinkan kalian untuk menyelesaikan beberapa puzzle disepanjang permainan. Tipe gameplaynya masih sama dengan serial sebelumnya yaitu Phantom Hourglass.
- Kali ini Link tidak bertualang sendirian, selama dalam dungeon Link akan ditemani oleh Phantom yang akan melindungi Link sesuai dengan perintah yang diberikan.
- Ketika dalam kereta api, pemain bisa menikmati berbagai aksi dan sebuah pemecahan puzzle secara real time.
- Link dapat menggunakan berbagai item dan senjata termasuk Whirlwind yang bisa diaktifkan oleh pemain dengan meniup melalui Microphone NDS kalian.
- Sama seperti game sebelumnya, pemain juga bisa membuat sebuah notes dengan stylus milik kalian.